这种神秘体验的就是那些细而长,嵌满彩色玻璃,幽暗而神秘的哥特式彩色玻璃花窗——哥特式建筑的显著装饰特色之一。而米兰大教堂的玻璃窗可能是全世界最大的,高约20米,共有24扇,主要以耶稣故事作为主题,正中的太阳光彩图案寓意正义和仁爱,这些彩色玻璃没有在长达500多年前的风风雨雨中损毁,至今仍光彩夺目
彩色玻璃的鼎盛时期发生在欧洲中世纪,当时工匠协会为教堂、修道院和精英家庭生产彩色玻璃窗,中世纪教堂艺术的蓬勃发展归功于阿尔伯特·苏格的努力
教堂的另外一个重点是彩色玻璃,在教堂内的彩色玻璃都非常特别,用玻璃制作图像台凸显出圣经里的人物或是故事,如为基督教徒会被这里的彩色玻璃所吸引,在教堂内部总共有56个玻璃窗,31个圆形的玫瑰图案以及25个彩色幅彩色玻璃窗的精美图案,但是在这56个玻璃窗只有4个是最完整无瑕的,其它的玻璃窗都是在1949-1951由当地主教的居民进行一些整修,而这些彩色玻璃窗都是由法国沙特尔省的LorinFirm所制造。